MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 substr. GT-I

Total Repeats: 66792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017038	GC	3	6	2	7	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017038	GTG	2	6	68	73	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017038	GCG	2	6	88	93	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017038	TCT	2	6	167	172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017038	GGT	2	6	202	207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017038	ATT	2	6	211	216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017038	A	6	6	306	311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017038	CT	3	6	328	333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017038	TG	4	8	385	392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017038	ATC	2	6	393	398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017038	CCGG	2	8	488	495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017038	AATT	2	8	567	574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017038	GA	3	6	721	726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017038	GTC	2	6	759	764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017038	T	6	6	786	791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017038	T	6	6	836	841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017038	TGC	2	6	971	976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383320911
18	NC_017038	CCA	2	6	1026	1031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383320911
19	NC_017038	GCG	2	6	1089	1094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383320911
20	NC_017038	C	6	6	1162	1167	0 %	0 %	0 %	100 %	383320911
21	NC_017038	TCC	2	6	1173	1178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383320911
22	NC_017038	CCA	2	6	1202	1207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383320911
23	NC_017038	CCCTA	2	10	1278	1287	20 %	20 %	0 %	60 %	383320911
24	NC_017038	CAG	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383320911
25	NC_017038	GAA	2	6	1417	1422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383320911
26	NC_017038	A	6	6	1471	1476	100 %	0 %	0 %	0 %	383320911
27	NC_017038	CTCC	2	8	1501	1508	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_017038	C	6	6	1507	1512	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_017038	ATC	2	6	1565	1570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017038	GCC	2	6	1613	1618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383320912
31	NC_017038	GAA	2	6	1619	1624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383320912
32	NC_017038	CAGG	2	8	1643	1650	25 %	0 %	50 %	25 %	383320912
33	NC_017038	TGG	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320912
34	NC_017038	A	6	6	1724	1729	100 %	0 %	0 %	0 %	383320912
35	NC_017038	TCA	2	6	1806	1811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320912
36	NC_017038	CCT	2	6	1867	1872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383320912
37	NC_017038	GTG	2	6	1991	1996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320912
38	NC_017038	GGT	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320912
39	NC_017038	AAC	2	6	2016	2021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320912
40	NC_017038	TTTG	2	8	2090	2097	0 %	75 %	25 %	0 %	383320912
41	NC_017038	GAA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017038	C	6	6	2228	2233	0 %	0 %	0 %	100 %	383320913
43	NC_017038	GTC	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383320913
44	NC_017038	TGGAG	2	10	2411	2420	20 %	20 %	60 %	0 %	383320913
45	NC_017038	CCA	2	6	2421	2426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383320913
46	NC_017038	AAT	2	6	2750	2755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383320913
47	NC_017038	GCG	2	6	2797	2802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383320913
48	NC_017038	T	8	8	2817	2824	0 %	100 %	0 %	0 %	383320913
49	NC_017038	CAT	2	6	2831	2836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320913
50	NC_017038	GTT	2	6	2840	2845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383320913
51	NC_017038	TAT	2	6	2906	2911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017038	GCG	2	6	2923	2928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017038	AC	3	6	2930	2935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017038	A	6	6	2940	2945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017038	TTCA	2	8	3013	3020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017038	AGC	2	6	3048	3053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017038	TCA	2	6	3233	3238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320914
58	NC_017038	ATCG	2	8	3324	3331	25 %	25 %	25 %	25 %	383320914
59	NC_017038	GTT	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383320914
60	NC_017038	ATT	2	6	3387	3392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383320914
61	NC_017038	AAT	2	6	3402	3407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383320914
62	NC_017038	TGG	2	6	3524	3529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320914
63	NC_017038	GAA	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383320914
64	NC_017038	AGGT	2	8	3751	3758	25 %	25 %	50 %	0 %	383320914
65	NC_017038	AAG	2	6	3784	3789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383320914
66	NC_017038	TTG	2	6	3853	3858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383320914
67	NC_017038	CAA	2	6	3912	3917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320914
68	NC_017038	GGT	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320914
69	NC_017038	TCA	2	6	4234	4239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320914
70	NC_017038	GTT	2	6	4272	4277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017038	CAAT	2	8	4303	4310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017038	G	7	7	4391	4397	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017038	TTG	2	6	4423	4428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017038	AGT	2	6	4446	4451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320915
75	NC_017038	GTT	2	6	4459	4464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383320915
76	NC_017038	TGG	2	6	4543	4548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320915
77	NC_017038	AAT	2	6	4595	4600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383320915
78	NC_017038	TGG	2	6	4756	4761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320915
79	NC_017038	TCT	2	6	4869	4874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320915
80	NC_017038	CAA	2	6	4949	4954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320915
81	NC_017038	TTC	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320915
82	NC_017038	TCT	2	6	5013	5018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320915
83	NC_017038	CA	3	6	5066	5071	50 %	0 %	0 %	50 %	383320915
84	NC_017038	T	6	6	5078	5083	0 %	100 %	0 %	0 %	383320915
85	NC_017038	TGG	2	6	5094	5099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320915
86	NC_017038	CAT	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320915
87	NC_017038	C	6	6	5178	5183	0 %	0 %	0 %	100 %	383320915
88	NC_017038	AATT	2	8	5309	5316	50 %	50 %	0 %	0 %	383320915
89	NC_017038	CAA	2	6	5320	5325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320915
90	NC_017038	TGGT	2	8	5389	5396	0 %	50 %	50 %	0 %	383320915
91	NC_017038	AGGG	2	8	5415	5422	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017038	CCA	2	6	5456	5461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017038	GTT	2	6	5486	5491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017038	CCA	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383320916
95	NC_017038	TAA	2	6	5732	5737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383320916
96	NC_017038	TCA	2	6	5766	5771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320916
97	NC_017038	CCA	2	6	5857	5862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383320916
98	NC_017038	CGG	2	6	6036	6041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383320916
99	NC_017038	G	6	6	6040	6045	0 %	0 %	100 %	0 %	383320916
100	NC_017038	GGT	2	6	6164	6169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320916
101	NC_017038	GAA	2	6	6210	6215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383320916
102	NC_017038	TCT	2	6	6387	6392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320916
103	NC_017038	GCG	2	6	6398	6403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383320916
104	NC_017038	GTG	2	6	6408	6413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320916
105	NC_017038	GAT	2	6	6478	6483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320916
106	NC_017038	ATG	2	6	6519	6524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320916
107	NC_017038	CAA	3	9	6548	6556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320916
108	NC_017038	AAC	2	6	6602	6607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320916
109	NC_017038	A	6	6	6800	6805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017038	ACTG	2	8	6868	6875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017038	ATT	2	6	6924	6929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017038	ATT	2	6	6934	6939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017038	A	6	6	7068	7073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017038	CAA	2	6	7300	7305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320917
115	NC_017038	GGTT	2	8	7319	7326	0 %	50 %	50 %	0 %	383320917
116	NC_017038	TGA	2	6	7335	7340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320917
117	NC_017038	CCA	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383320917
118	NC_017038	TCA	2	6	7371	7376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320917
119	NC_017038	CGC	2	6	7387	7392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383320917
120	NC_017038	C	6	6	7394	7399	0 %	0 %	0 %	100 %	383320917
121	NC_017038	AAC	2	6	7451	7456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320917
122	NC_017038	ATC	2	6	7457	7462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320917
123	NC_017038	TGT	2	6	7471	7476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383320917
124	NC_017038	CTT	2	6	7479	7484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320917
125	NC_017038	GGT	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320917
126	NC_017038	GTA	2	6	7571	7576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320917
127	NC_017038	GTC	2	6	7611	7616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383320917
128	NC_017038	TG	3	6	7658	7663	0 %	50 %	50 %	0 %	383320917
129	NC_017038	CCG	2	6	7692	7697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383320917
130	NC_017038	GGT	2	6	7847	7852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320917
131	NC_017038	CCT	3	9	7887	7895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383320917
132	NC_017038	ACC	2	6	7907	7912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383320917
133	NC_017038	AAG	3	9	7950	7958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383320917
134	NC_017038	ACA	2	6	7965	7970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320917
135	NC_017038	GCC	2	6	7976	7981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383320917
136	NC_017038	CTT	2	6	8016	8021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320917
137	NC_017038	CAA	2	6	8023	8028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320917
138	NC_017038	CTT	3	9	8044	8052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320917
139	NC_017038	TTCAAC	2	12	8126	8137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320917
140	NC_017038	CTG	2	6	8295	8300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383320917
141	NC_017038	AAT	2	6	8334	8339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017038	G	6	6	8364	8369	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017038	TCT	2	6	8392	8397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017038	ATCG	2	8	8418	8425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017038	AG	3	6	8452	8457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017038	GAA	2	6	8498	8503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383320918
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404	NC_017038	TAC	2	6	22287	22292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320927
405	NC_017038	TCC	2	6	22300	22305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383320927
406	NC_017038	C	6	6	22313	22318	0 %	0 %	0 %	100 %	383320927
407	NC_017038	CTC	2	6	22320	22325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383320927
408	NC_017038	AAT	2	6	22336	22341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383320927
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411	NC_017038	AT	3	6	22472	22477	50 %	50 %	0 %	0 %	383320927
412	NC_017038	A	6	6	22486	22491	100 %	0 %	0 %	0 %	383320927
413	NC_017038	CAA	2	6	22500	22505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320927
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425	NC_017038	TACA	2	8	22881	22888	50 %	25 %	0 %	25 %	383320927
426	NC_017038	T	6	6	22918	22923	0 %	100 %	0 %	0 %	383320927
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432	NC_017038	ATTA	2	8	23134	23141	50 %	50 %	0 %	0 %	383320928
433	NC_017038	TCA	2	6	23216	23221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320928
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435	NC_017038	CAA	2	6	23399	23404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320928
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454	NC_017038	ATT	2	6	24362	24367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383320929
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